全國985大學共有39所，其中一期名單共有34所大學，二期名單共有5所大學。
第一期：清華大學、北京大學、廈門大學、中國科學技術大學、南京大學、復旦大學、天津大學、哈爾濱工業大學、浙江大學、南開大學、西安交通大學、華中科技大學、東南大學、武漢大學、上海交通大學、中國海洋大學、山東大學、湖南大學、中國人民大學、北京理工大學、吉林大學。
第二期：
中國農業大學、國防科技大學、西北農林科技大學、華東師範大學、中央民族大學。
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