1、阿拉比卡種,即小粒種。原產地是衣索比亞的阿比西尼亞高原,初期主要用作藥用。2、羅布斯塔種,即中粒種。是在非洲剛果發現的耐葉鏽病品種,較阿拉比卡種有更強的抗病力。3、利比亞種,即大粒種。原產非洲的利比亞,常綠喬木。果實大,長圓形,種皮緊貼種仁,成熟時爲硃紅色。
全世界的咖啡豆中,阿拉比卡種的咖啡約佔65%--80%,他絕佳的風味與香氣,使他成爲這些原生種中唯一能夠直接、單獨飲用的咖啡。但其對於乾燥、霜害、病蟲害等的抵抗力度低,特別是不耐咖啡最大的天敵——葉鏽病,因而各生產國無不致力於改良品種。
羅布斯塔種的咖啡樹是常綠小喬木樹種,葉片較長,顏色亮綠,樹最高可達10米,但樹根卻很淺,果實爲扁圓形,成熟時爲紫色,種皮較薄,緊貼種仁,不易分離,豆身扁圓,中間坑紋直,飲用味濃而香。其栽培面積僅次於阿拉比卡種。
利比亞種分佈於利比里亞、馬來西亞、印度、印尼。其飲用風味濃烈,咖啡鹼含量中等,刺激性強,質量較差,栽培面積較小。